Следует учесть, что операции по передаче и возврату имущества по договору доверительного управления имуществом не являются на основании положений статьи 39 НК РФ объектом налогообложения по НДС, поскольку они не признаются реализацией для целей налогообложения.

Более того, на основании подпункта 2 пункта 3 статьи 170 НК РФ при передаче имущества по договору доверительного управления имуществом передающая сторона (если она является плательщиком НДС) должна восстановить суммы ранее принятого налога к вычету. Однако такой вывод налоговых органов можно оспорить. Дело в том, что положения подпункта 2 пункта 3 статьи 170 НК РФ содержат указание лишь на восстановление налога на добавленную стоимость в рамках договора о совместной деятельности и в нем нет ссылки на договор доверительного управления имуществом.

Данная норма не совсем характерна для логики главы 21 НК РФ, однако, принимающая сторона вправе принять данную сумму восстановленного налога к вычету.

Как уже отмечалось в статье, доверительный управляющий должен обеспечить раздельный учет операций по доверительному управлению имуществом, а также собственных операций доверительного управляющего. Более того, в соответствии с положениями статьи 332 НК РФ если организация или индивидуальный предприниматель выступает доверительным управляющим по нескольким договорам доверительного управления, то учет должен вестись отдельно по каждому договору доверительного управления имущества.

Следует также помнить, что организация или индивидуальный предприниматель, применяющий упрощенную систему налогообложения и выступающий доверительным управляющим, обязан подавать в установленный срок налоговую декларацию по НДС. Обратите внимание, как указали налоговые органы в Письмах УФНС России по городу Москве от 29 марта 2008 года №19-11/19233, а также в Письме УФНС России по городу Москве от 7 ноября 2006 года, при подаче налоговой декларации по НДС доверительный управляющий должен сделать соответствующую пометку в декларации о том, что он является доверительным управляющим по договору доверительного управления имуществом. Более того, налоговые органы столицы указали на то, что если упрощенец выступает доверительным управляющим по нескольким договорам доверительного управления имуществом, он подает одну налоговую декларацию по месту своей регистрации в качестве налогоплательщика.